Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Neurl3Q8CJC5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms