Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms