Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms