Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ttc28Q80XJ3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms