Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Defa17Q64016 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa17Q64016 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms