Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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AtrxQ61687 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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AtrxQ61687 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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