Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Rgs9-204ENSMUST00000106706 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Enpp3-203ENSMUST00000218044 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ncor1Q60974 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Chn2-203ENSMUST00000114401 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ncor1Q60974 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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