Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms