Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Sft2d1Q5SSN7 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms