Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
D13Ertd608eQ3UPR8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
D13Ertd608eQ3UPR8 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms