Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp30Q3UN04 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms