Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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