Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp2Q06649 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms