Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Grin2cQ01098 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms