Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PrcdQ00LT2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms