Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhodP97348 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhodP97348 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhodP97348 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms