Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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