Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SgcbP82349 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcbP82349 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SgcbP82349 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SgcbP82349 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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SgcbP82349 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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