Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gp1bbP56400 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms