Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrprbP47758 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms