Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdkn1bP46414 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms