Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc11P31313 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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