Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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