Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcnaP17918 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms