Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa-rs1P17533 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa-rs1P17533 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms