Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pou4f1P17208 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pou4f1P17208 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pou4f1P17208 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pou4f1P17208 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Pou4f1P17208 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pou4f1P17208 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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