Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P10404 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P10404 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
P10404 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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