Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01666 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01666 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01666 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms