Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kpna3O35344 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms