Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm21976J3QNN2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm21976J3QNN2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21976J3QNN2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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