Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms