Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rad51b-201ENSMUST00000079533 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ston2-203ENSMUST00000164713 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pex5l-209ENSMUST00000193289 3526 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 C78197-201ENSMUST00000152781 3417 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr531-202ENSMUST00000216053 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 D630039A03Rik-201ENSMUST00000063816 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm33882-201ENSMUST00000208990 651 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AC154862.1-201ENSMUST00000225060 1763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ncaph2-201ENSMUST00000036987 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Taok3-201ENSMUST00000092889 4354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Txnrd1-205ENSMUST00000219368 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms