Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm10378F6XQQ1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm10378F6XQQ1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm10378F6XQQ1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm10378F6XQQ1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm10378F6XQQ1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm10378F6XQQ1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm10378F6XQQ1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm10378F6XQQ1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm10378F6XQQ1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm10378F6XQQ1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm10378F6XQQ1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm10378F6XQQ1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm10378F6XQQ1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm10378F6XQQ1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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