Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc1E9Q043 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms