Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc8E9PWG2 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms