Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms