Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Clrn2B2RVW2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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