Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usf3B2RUQ2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms