Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Prr29B1ARI9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Prr29B1ARI9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Prr29B1ARI9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prr29B1ARI9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prr29B1ARI9 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prr29B1ARI9 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Prr29B1ARI9 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prr29B1ARI9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms