Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ckap5A2AGT5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms