Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Speer3W4VSP1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Speer3W4VSP1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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