Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms