Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ube3bQ9ES34 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ube3bQ9ES34 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms