Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms