Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Pramef12Q9D2F1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms