Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms