Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 1810059H22Rik-201ENSMUST00000203249 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CQ90 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms