Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnps1Q99M28 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms