Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms