Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Slc8b1Q925Q3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Slc8b1Q925Q3 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Slc8b1Q925Q3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Slc8b1Q925Q3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc8b1Q925Q3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms